教員紹介

ACADEMICIAN

木村 博一  KIMURA Hirokazu

  • 医療技術学部 臨床工学科
  • 教授

研究分野

微生物学・感染症学・生体防御学

学位

博士(工学)

大学院

保健科学研究科 保健科学専攻
特別研究指導教員

  • 博士前期課程

    公衆衛生学領域

    公衆衛生学特別研究/感染症疫学・感染制御学

    先端病原体ゲノム解析法(シークエンス法及びメタゲノム解析法など)を基盤とした分子疫学解析法について学びます。また、病原体抗原遺伝子配列に、先駆的in silico解析を加え、感染症の原因究明、ワクチン開発のみならず、集団感染事例における感染源の特定などに関する解析手法論についても学びます。

  • 博士後期課程

    医療科学領域

    医療科学特別研究/病原体遺伝子

    細菌の薬剤耐性遺伝子、呼吸器ウイルス(RSウイルス・ヒトライノウイルスなど)および下痢症ウイルス(ノロウイルス・ロタウイルスなど)の遺伝学的解析を基盤とした研究指導を行います。また、ベイジアン・スカイラインプロット法によるウイルス遺伝子型別流行予測プログラムの開発に関する研究指導も行います。

研究や大学院進学についての質問・相談などを受付けています。

経歴

学歴
2000年 群馬大学大学院工学研究科博士後期課程修了・学位取得 [博士(工学)]

職歴
1984年4月~1992年3月 群馬県立小児医療センター・心臓血管センター検査課
1992年4月~2003年3月 群馬県衛生環境研究所・保健科学部ウイルス課
2003年4月~2006年3月 群馬県衛生環境研究所・調査研究グループリーダー
2006年4月~2017年8月 国立感染症研究所感染症疫学センター第6室長
2017年9月~2022年3月    群馬パース大学保健科学部検査技術学科 教授
2018年4月~現在    群馬パース大学大学院保健科学研究科医療科学領域 教授
2006年4月~2017年8月 国立保健科学医療科学院 併任
2016年4月~現在    横浜市立大学大学院医学研究科客員教授(医学科ウイルス学兼担)
2017年4月~現在    群馬大学医学部客員教授(医学科ウイルス学兼担)
2020年1月~現在    認定ICD(Infection Control Doctor)
2020年4月~現在    日本大学理工学部客員教授
2022年4月~現在    群馬パース大学臨床工学科 教授

研究内容

病原体ゲノムの網羅解析を行い、病原体の進化に関する研究を行っています。また、ゲノム解析技術とバイオインフォマティクス技術を応用して、呼吸器ウイルスや下痢症ウイルス感染症の感染源の解明や流行予測に関する研究も行っています。さらに、ウイルス感染症の重症化の機構解明やウイルス検査法の開発に関する研究も行っています。

研究実績詳細

(1)Kimura H, Nagasawa K, Kimura R, Tsukagoshi H, Matsushima Y, Fujita K, Hirano E, Ishiwada N, Misaki T, Oishi K, Kuroda M, Ryo A. Molecular evolution of the fusion protein (F) gene in human respiratory syncytial virus subgroup B. Infect Genet Evol. 52:1-9, 2017.
(2)Mizukoshi F, Nagasawa K, Doan YH, Haga K, Yoshizumi S, Ueki Y, Shinohara M, Ishikawa M, Sakon N, Shigemoto N, Okamoto-Nakagawa R, Ochi A, Murakami K, Ryo A, Suzuki Y, Katayama K, Kimura H. Molecular evolution of the RNA-dependent RNA polymerase and capsid genes of human norovirus genotype GII.2 in Japan during 2004–2015. Front Microbiol. 8:705, 2017.
(3)Miyakawa K, Nishi M, Matsunaga S, Okayama A, Anraku M, Kudoh A, Hirano H, Kimura H, Morikawa Y, Yamamoto N, Ono A, Ryo A. The tumor suppressor APC promotes HIV-1 assembly via interaction with Gag precursor protein. Nat Commun. 30;8:14259, 2017.
(4)Kobayashi M, Matsushima Y, Motoya T, Sakon N, Shigemoto N, Okamoto-Nakagawa R, Nishimura K, Yamashita Y, Kuroda M, Saruki N, Ryo A, Saraya T, Morita Y, Shirabe K, Ishikawa M, Takahashi T, Shinomiya H, Okabe N, Nagasawa K, Suzuki Y, Katayama K, Kimura H. Molecular evolution of the capsid gene in human norovirus genogroup II. Sci Rep. 6:29400, 2016.
(5)Kimura H, Nagasawa K, Tsukagoshi H, Matsushima Y, FujitaK, Yoshida LY, Tanaka R, Ishii H, Shimojo N, Kuroda M, Ryo A. Molecular evolution of the fusion protein gene in human respiratory syncytial virus subgroup A. Infect Genet Evol. 43:398-406, 2016.
(6)Sugai K, Kimura H, Miyaji Y, Tsukagoshi H, Yoshizumi M, Sasaki-Sakamoto T, Matsunaga S, Yamada Y, Noda M,Ikeda M, Kozawa K, Ryo A, Yoshihara S, Ogata H, Okayama Y. MIP-1a level in nasopharyngeal aspirates at first wheezing episode predicts recurrent wheezing. J Allergy Clin Immunol. 137(3):774-781, 2016.
(7)Kobayashi M, Yoshizumi S, Takahashi T, Ueki Y, Shinohara M, Mizukoshi F, Tsukagoshi H, Sasaki Y, Suzuki R, Shimizu H, Iwakiri A, Okabe N, Shirabe K, Shinomiya H, Kozawa K, Ryo A, Kuroda M, Katayama K, Kimura H, Molecular Evolution of the capsid gene in norovirus genogroup I. Sci Rep. 4;5:13806, 2015.
(8)Kimura H, Saitoh M, Kobayashi M, Ishii H, Saraya T, Kurai D, Tsukagoshi H, Shirabe K, Nishina A, Kozawa K, Kuroda M, Takeuchi F, Sekizuka T, Minakami H, Ryo A, Takeda M. Molecular evolution of haemagglutinin (H) gene in measles virus. Sci Rep. 5:11648, 2015.
(9)Miyakawa K, Matsunaga S, Kanou K, Matsuzawa A, MorishitaR, Kudoh A, Shindo K, Yokoyama M, Sato H, Kimura H, Tamura T, Yamamoto N, Ichijo H, Takaori-Kondo A, Ryo A. ASK1 restores the antiviral activity of APOBEC3G by disrupting HIV-1 Vif-mediated counteraction. Nat Commun. 6:6945.1.2015.
(10)Kuroda M, Niwa S, Sekizuka T, Tsukagoshi H, Yokoyama M, Ryo A, Sato H, Kiyota N, Noda M, Kozawa K, Shirabe K, Kusaka T, Shimojo N, Hasegawa S, Sugai K, Obuchi M, Tashiro M, Oishi K, Ishii H, Kimura H. Molecular evolution of the VP1, VP2, and VP3 genes in human rhinovirus species C. Sci Rep. 5:8185, 2015.
(11)Hirano E, Kobayashi M, Tsukagoshi H, Yoshida LM, Kuroda M, Noda M, Ishioka T, Kozawa K, Ishii H, Yoshida A, Oishi K, Ryo A, Kimura H, Molecular evolution of human respiratory syncytial virus attachment glycoprotein (G) gene of new genotype ON1 and ancestor NA1. Infect Genet Evol. 28:183-191, 2014.
(12)Nishi M, Akutsu H, Kudoh A, Kimura H, Yamamoto N, Umezawa A, Lee SW, Ryo A. Induced cancer stem-like cells as a model for biological screening and discovery of agents targeting phenotypic traits of cancer stem cell. Oncotarget. 5(18):8665-8680, 2014.
(13)Nishi M, Sakai Y, Akutsu H, Nagashima Y, Quinn G, Masui S, Kimura H, Perrem K, Umezawa A, Yamamoto N,Lee SW, Ryo A. Induction of cells with cancer stem-cell properties from non-tumorigenic human mammary epithelial cells by defined reprogramming factors. Oncogene. 33(5):643-52, 2014.
(14)Kobayashi M, Takayama I, Kageyama T, Tsukagoshi H, Saitoh M, Ishioka T, Yokota Y, Kimura H, Tashiro M, Kozawa K. A new reassortant swine influenza A (H1N2) virus derived from A (H1N1) pdm09 virus isolated from swine. Emerg Infect Dis. 19(12):1972-4, 2013.
(15)Abe M, Tahara M, Yamaguchi H, Kanou K, Shirato K, Kawase M, Noda M, Kimura H, Matsuyama S, Fukuhara H, Mizuta K, Maenaka K, Ami Y, Esumi M, Kato A, Takeda M. TMPRSS2 is an activating protease for respiratory parainfluenza viruses. J Virol. 87(21):11930-11935, 2013.
(16)Sakano C, Kuroda M, Sekizuka T, Ishioka T, Morita Y, Ryo A, Tsukagoshi H, Kawai Y, Inoue N, Takada H, Ogasawara Y, Nishina A, Shimoda M, Kozawa K, Oishi K, Kimura H. Genetic analysis of non-hydrogen sulfide-producing Salmonella enterica serovar Typhimurium and Infantis isolates in Japan. J Clin Microbiol. 51(1):328-330, 2013.
(17)Kobayashi M, Tsukagoshi H, Ishioka T, Mizuta K, Noda M, Morita Y, Ryo A, Kozawa K, Kimura H. Seroepidemiology of saffold cardiovirus (SAFV) genotype 3 in Japan. J Infect. 66(2):191-193, 2013.
(18)Miyakawa K, Sawasaki T, Matsunaga S, Tokarev A, Quinn G, Kimura H, Nomaguchi M, Adachi A, Yamamoto N, Guatelli J, Ryo A. Interferon-Induced SCYL2 Limits Release of HIV-1 by Triggering PP2A-Mediated Dephosphorylation of the Viral Protein Vpu. Sci Signal. 5(245):ra73, 2012.
(19)Fujitsuka A, Tsukagoshi H, Arakawa M, Goto-Sugai K, Ryo A, Okayama Y, Mizuta K, Nishina A, Yoshizumi M, Kaburagi Y, Noda M, Tashiro M, Okabe N, Mori M, Yokota S, Kimura H. A molecular epidemiological study of respiratory viruses detected in Japanese children with acute wheezing illness. BMC Infect Dis. 11:168, 2011.
(20)Mukai H, Seki T, Nakano H, Hokari Y, Takao T, Kawanami M, Tsukagoshi H, Kimura H, Kiso Y, Shimonishi Y, Nishi Y, Munekata E. Mitocryptide-2: Purification, ientification ,and characterization of a novel cryptide that activates neutrophils. J Immunol. 182(8):5072-5080, 2009.
(21)Mukai H, Hokari Y, Seki T, Takao T, Kubota M, Matsuo Y, Tsukagoshi H, Kato M, Kimura H, Shimonishi Y, Kiso Y, Nishi Y, Wakamatsu K, Munekata E. Discovery of mitocryptide-1, a neutrophil-activating cryptide from healthy porcine heart. J Biol Chem. 283(45):30596-30605, 2008.
(22)Okazaki K, Kondo M, Kato M, Kakinuma R, Nishida A, Noda M, Taniguchi K, Kimura H. Serum cytokine and chemokine profiles in neonates with meconium aspiration syndrome. Pediatrics. 121(4):e748-e753, 2008.
(23)Tsukagoshi H, Koketsu M, Kato M, Kurabayashi M, Nishina A, Kimura H. Superoxide radical (O2-) scavenge effects from polymorphonuclear leukocytes and toxicity in human cell lines of newly synthesized organic selenium compounds. FEBS J. 274(23):6046-6054, 2007.
(24)Wada T, Toma T, Okamoto H, Kasahara Y, Koizumi S, Agematsu K, Kimura H, Shimada A, Hayashi Y, Kato M, Yachie Y. Oligoclonal expansion of T lymphocytes with multiple second-site mutations leads to Omenn syndrome in a patient with RAG1-deficient severe combined immunodeficiency. Blood. 106(6):2099-2101, 2005.
(25)Nishida T, Kimura H, Saitoh M, Shinohara M, Kato M, Fukuda S, Munemura T, Mikami T, Kawamoto A, Akiyama M, Kato Y, Nishi K, Kozawa K, Nishio O. Detection, quantitation, and phylogenetic analysis of noroviruses in Japanese oysters. Appl Environ Microbiol. 69(10):5782-5786, 2003.
(26)Kimura H, Saitoh M, Miyakubo H, Yoshida H, Kato K, Nagai A, Kozawa K. Keratoconjunctivitis caused by echovirus type 13 in Japanese children. Pediatr Infect Dis J. 22(8):758-759, 2003.
(27)Kato M, Suzuki M, Tachibana A, Takizawa T, Arkawa H, Mochizuki H, Tokuyama K, Kimura H, Hanaka H, Izumi T, Morikawa A. Actin assembly is a crucial role on effector functions of adherent human eosinophils. J Allegy Clin Immunol. 111(1): 126-33, 2003.
(28)Kato M, Kimura H, Motegi Y, Tachibana A, Minakami H, Morikawa A, Kita H. Platelet-activating factor activates two distinct signaling and effector pathways in human eosinophils. J Immunol. 169(9):5252-5259, 2002.
(29)Takizawa T, Kato M, Kimura H, Tachibana A, Fujiu T, Suzuki M, Tokuyama K, Morikawa A. Inhibition of protein kinase A and C exhibits dual modes of responses in human eosinophils stimulated by platelet-activating factor. J Allergy Clin Immunol. 110:241-248, 2002.
(30)Okada Y, Kato M, Minakami H, Inoue Y, Morikawa A, Otsuki K, Kimura H. Reduced expression of FLICE-inhibitory protein (FLIP) and NFkB1 is associated with death receptor-induced cell death in human aortic endothelial cells (HAECs). Cytokine. 15(2):66-74, 2001.
(31)Kimura H, Minakami H, Harigaya A, Takeuchi H, Tachibana A, Otsuki K. Treatment of neonatal infection caused by coxsackievirus B3. J Perinatol. 19(5):388-390, 1999.
(32)Kimura H, Minakami H, Kimura S, Sakurai T, Nakamura T, Kurashige S, Nakano M, Shoji A. Release of superoxide radicals by mouse macrophages stimulated by oxidative modification of glycated low density lipoproteins. Atherosclerosis 118:1-8, 1995.
(33)Sakurai T, Kimura S, Nakano M, and Kimura H. The oxidative modification of low density lipoprotein by nonenzymatically glycated peptide-Fe complex. Biochim Biophys Acta. 1086:273-278, 1991.
(34)Nakano M, Kimura H, Hara M, Kuroiwa M, Kato M, Totsune K, Yoshikawa T. A highly sensitive method for determining both Mn- and Cu-Zn superoxide dismutase activities in tissues and blood cells. Anal Biochem. 187:277-280, 1990.
(35)Kimura H, Nakano M. Highly sensitive and reliable chemiluminescence method for the assay of superoxide dismutase in human erythrocytes. FEBS Lett. 239(2):347- 350, 1988.

その他

  • 【主な学会活動】

    Frontiers in Microbiology (Associate Editor)
    Frontiers in Plant Science (Associate Editor)
    Microorganisms (Academic Editor)
    BMC Infectious Diseases (Associate Editor)
    Infection Genetics and Evolution (Handling Editor)
    Gut Pathogens (Associate Editor)
    日本ウイルス学会(ウイルス検査体制委員会委員)
    日本感染症学会

メッセージ

私たちは、医学・薬学および工学的手法を用い、微生物学、感染症学および生体防御学の基礎・臨床分野に関する研究・教育を行っています。今後、いろいろな感染症の検査診断法の開発を含む微生物学分野の研究は、ますます重要になってくることが予想されます。将来、臨床検査技師を目指すだけでなく、微生物学の研究に興味のある方は研究室に気軽にお越しください。心よりお待ちしております。   附属研究所 先端医療科学研究センター

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